Я бывший атеист. Сейчас христианин. Из Библии знаем, что Бог есть дух. И познать Бога можно только духовно. А если проще, вступив в общение с Ним. Мы говорим с Богом в молитве, Бог говорит с нами в Библии. И по мере того, как мы подтверждаем свое желание к общению с Богом, Бог все больше и больше открывается нам, через разум. Наступает покаяние. По гречески метания. Посмотрите в вики. Наступает момент, когда сомнения в бытие Божием просто исчезает. Ты рождавшийся духовно. Как и говорил Христос.