Биосинтез белка — фундаментальный процесс, от которого зависит функционирование и выживание любой живой клетки. Как именно происходит этот сложный механизм, запускаемый тысячи раз в секунду в каждом организме? Давайте разберемся.
История изучения биосинтеза белка
Первые экспериментальные свидетельства роли РНК в синтезе белка появились в конце 1930-х - начале 1940-х годов. Торбьерн Касперссон и Джек Шульц разработали методы анализа поглощения ультрафиолетового излучения нуклеиновыми кислотами в клетках. Они обнаружили, что образование белка связано с повышенным присутствием РНК в определенных ядерных и цитоплазматических структурах.
Белки рассматривались как ключевые вещества живых организмов, которые не только выполняют биохимические функции, но и участвуют в наследственной передаче информации.
Однако конкретный механизм синтеза белка оставался неясным. Одной из гипотез была идея "реверсивного протеолиза", выдвинутая такими авторитетами как Макс Бергман и Джозеф Фрутон. Считалось, что белки образуются в результате случайного гидролиза белковых агрегатов ("протеоидов") с последующей сборкой функциональных молекул.
Эта гипотеза была опровергнута с появлением методов радиоактивной метки аминокислот и анализа их включения в белки. Выяснилось, что порядок аминокислот в белках неслучаен, а задается направленным биосинтезом.
Обзор процесса транскрипции
Первым этапом биосинтеза белка является транскрипция — синтез молекул информационной РНК (иРНК) на матрице ДНК. Этот процесс катализируется ферментом РНК-полимеразой, которая расплетает двойную спираль ДНК в области нужного гена и синтезирует комплементарную цепь иРНК путем последовательного присоединения рибонуклеотидов.
- РНК-полимераза узнает промотор — регуляторный участок ДНК перед геном.
- Происходит инициация транскрипции — полимераза "садится" на матрицу и начинает синтез иРНК.
- По ходу движения фермента образуется все более длинная цепь РНК.
- Полимераза доходит до терминаторной последовательности, освобождает иРНК и цепи ДНК восстанавливают двойную спираль.
Так образуется первичный транскрипт, который затем подвергается процессингу — "созреванию". Происходит модификация концов молекулы, сплайсинг (вырезание некодирующих интронов) и упаковка в рибонуклеопротеиновые комплексы. После этого зрелая иРНК транспортируется из ядра в цитоплазму.
Транскрипция — обязательная стадия, без которой невозможен последующий биосинтез белка в клетке. Информация о структуре белка должна быть "переписана" с языка ДНК на язык РНК для доставки к месту синтеза — рибосомам.
Обзор процесса трансляции
Вторым этапом является трансляция — собственно синтез полипептидной цепи на рибосомах по матрице иРНК. В этом сложном процессе участвует множество клеточных компонентов.
- Информационная РНК служит матрицей, несущей код будущего белка.
- Транспортные РНК доставляют аминокислоты, кодируемые комплементарными кодонами иРНК.
- Рибосома — это своеобразный аппарат, который считывает кодоны иРНК и присоединяет аминокислоты в полипептидную цепь.
- Ферменты обеспечивают образование пептидных связей между аминокислотами.</ли>
Синтез белка на рибосоме проходит в три основных этапа:
- Инициация — узнавание старт-кодона на иРНК, фиксация первой аминокислоты.
- Элонгация — последовательное присоединение аминокислот в растущую цепь.
- Терминация — остановка синтеза при встрече стоп-кодона, освобождение полипептида.
Трансляция повторяется тысячи раз в секунду в клетках всех живых организмов. Это основа жизни на молекулярном уровне!
Регуляция биосинтеза белка в клетке
Биосинтез белка в клетке — высокозатратный и тонко регулируемый процесс. На него влияют как внешние (температура, доступность питательных веществ), так и внутренние факторы.
Гормоны | Регулируют активность генов на уровне транскрипции |
Факторы транскрипции | Связываются с ДНК и запускают или подавляют экспрессию генов |
Кроме того, клетки имеют несколько контрольных точек на разных стадиях синтеза белка. Это позволяет избегать накопления ошибочных белковых продуктов и поддерживать протеомное равновесие. При нарушениях регуляции возникают тяжелые патологии вплоть до онкологических.
Энергетические затраты на биосинтез белка
Биосинтез белка — очень энергозатратный процесс. Основная доля расхода клеточного «топлива» в виде АТФ приходится на стадию трансляции, во время которой происходит полимеризация аминокислот.
По оценкам ученых, на трансляцию расходуется порядка 75% всего пула ГТФ в клетке. Это существенно больше, чем на транскрипцию (около 12%) и посттрансляционный фолдинг белков (3-4%)[1]. Таким образом, именно синтез полипептидной цепи является «узким местом» с точки зрения энергозатрат.
Центральной проблемой в клеточной физиологии является определение стоимости производства белка и молекулярных процессов, ограничивающих биосинтез.
Высокая стоимость биосинтеза белка в клетке накладывает ограничения на ее рост и деление. Превышение определенного уровня экспрессии генов и продукции белка невозможно из-за нехватки энергоресурсов.
Биоинженерия белков
Благодаря углубленному пониманию механизмов биосинтеза белка появляется возможность их целенаправленного изменения - так называемая биоинженерия. Уже разработаны методы вставки нужных генов в клетки бактерий, дрожжей, млекопитающих для получения рекомбинантных белков.
- Инсулин человека производят в кишечной палочке с использованием генной инженерии.
- Фермент лактаза для снижения непереносимости лактозы получают из генетически модифицированных дрожжей.
Перспективны исследования по коррекции мутаций, вызывающих наследственные заболевания, с помощью РНК-терапии. Это позволит лечить такие болезни как муковисцидоз, болезнь Гентингтона на уровне исправления дефектного биосинтеза белка.
Нанотехнологии для анализа трансляции
Современные экспериментальные подходы дают все больше информации о деталях процесса синтеза белка в клетках. Одним из перспективных направлений является создание искусственных наноструктур для анализа работы рибосом и транспортных РНК:
- Нанопоры позволяют регистрировать движение рибосом вдоль иРНК с высоким разрешением.
- Микрочипы дают детальную картину взаимодействий тРНК с кодонами.
Такие подходы открывают путь к созданию эффективных биосенсоров для диагностики и мониторинга процесса в реальном времени, а также тест-систем для скрининга лекарственных препаратов.
Нерешенные вопросы
Несмотря на достигнутый прогресс, многие аспекты регуляции биосинтеза белка до конца неясны. К примеру, влияние различных стрессовых воздействий на трансляцию изучено пока недостаточно для создания эффективных терапевтических подходов.
Требуют уточнения механизмы контроля точности синтеза, распознавания и деградации ошибочных продуктов трансляции. Их нарушения приводят к тяжелым нейродегенеративным заболеваниям вроде болезни Альцгеймера. Здесь еще предстоит немало открытий ученым разных специальностей!